当人类精子与卵子结合形成受精卵时，精子即将核内的遗传信息传递给子代，保证胚胎发育。因此，精子染色体畸变或精子核不成熟，均可导致胚胎发育异常或终止。因此，怀孕两个月出现胎儿停育的情况，可能是受到男性精子的影响。
胚胎健康的发育，需要三个重要的激素水平，一个是雌激素，一个是孕激素，一个是人绒毛膜促性腺激素，作为母体来讲，自身的内源性激素不足，就满足不了胚胎的需要，就有可能造成胚胎的停止发育。
胎儿是父母的遗传物质的结合体和母体不可能完全相同，部分情况下，母体与胎儿之间免疫不适应可能会引起母体对胎儿的排斥，就会影响到胚胎的发育，导致胎儿停育的情况发生。这也是怀孕两个月出现胎停育需要考虑的方面。
子宫里的内环境和子宫整体的环境都有可能对胚胎有影响，如子宫内膜如果太薄或太厚、子宫宫腔狭小、宫腔粘连、子宫肌瘤、子宫内膜异位症、宫颈发育异常等子宫异常的情况，都可能是引起怀孕两个月的胎儿停育的原因。
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