新生儿在宫内能从母体获得某些抗体，抗体量的多少与胎龄有关。新生儿体内补体浓度低，约为成人的50％，不耐热因子也偏低，白细胞吞噬过程中的调理、趋化及吞噬作用较差，网状内皮系统的清除作用也较低。这些缺陷是新生儿容易发生败血症的原因。早产儿及新生儿患病时，这些免疫缺陷更为明显。
国内近年来仍以葡萄球菌为常见，其中白色葡萄球菌发病率较前增多，其次是金黄色葡萄球菌、大肠杆菌及绿脓杆菌。一次研究调查显示，引起的新生儿败血症的病原菌中白色葡萄球菌占半数；此外，厌氧菌在新生儿败血症的致病菌中占一定位置，易被漏诊，值得重视。
新生儿败血症可以有以下三种感染引起：
母亲的羊膜早破，超过6~12h，容易受到感染；或母亲分娩前有细菌感染，病原菌越过胎盘进入胎儿血循环或直接感染病儿而致病。
在分娩时，母亲有产科合并症．如产程延长、羊膜早破、羊水被污染或产道内细菌进入等使婴儿感染。
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