1.细菌
可能引起胃肠炎的细菌包括创伤弧菌、弯曲菌、沙门氏菌等等。
2.病毒
尽管人体对病毒的抵抗力很好，但多种的病毒仍可以引发肠胃炎。如轮状病毒、诺沃克病毒、星状病毒等等。特别是诺沃克病毒，任何季节在成人和儿童中均可致病，而且可以通过粪便-口传染、水源污染传染，容易引起严重腹泻。尤其在公共卫生不发达的国家或地区更容易暴发。
3.寄生虫
比较少见由肠道寄生虫引起肠胃炎。也不易传播。但该病症可引起慢性病或引起其他病变。2006年在中国各地均有发现由于生食螺肉(福寿螺、东风螺)而传染于人体的广州管圆线虫就可能引起肠胃炎并引起更严重的病变。
4.食物中毒
是更为模糊的病因，可由细菌毒素或病毒感染引起。
常以沙门菌属和嗜盐菌(副溶血弧菌)感染最常见，毒素以金黄色葡萄球菌常见，病毒亦可见到。常有集体发病或家庭多发的情况。如吃了被污染的家禽、家畜的肉、鱼;或吃了嗜盐菌生长的蟹、螺等海产品及吃了被金黄色葡萄球菌污染了的剩菜、剩饭等而诱发本病。
1.幽门螺杆菌
幽门螺杆菌是上消化道疾病的主要致病因素之一。特别是在慢性胃炎、消化性溃疡的发病中具有举足轻重的作用，几乎100%的慢性胃炎，90%以上的十二指肠溃疡和70%以上胃溃疡中可查出幽门螺杆菌(HP)检测阳性。因此，一定要做幽门螺杆菌检查。
HP-C13呼气胃病检测系统检测幽门螺杆菌系列是现代检测技术的产物。C13呼气胃病检测系统已被公认为目前检测幽门螺杆菌的有效方法，全程诊断过程约30分钟。是目前国际上公认的幽门螺杆菌检查的“金标准”。被称为“胃病检验史上的里程碑”。
2.电子肠镜
对于肠炎的患者来说，要想清楚的了解病变必须做常见检查，通过柔软的镜身伸入到肠道内，把里边的溃疡、糜烂、充血等情况清晰的呈现在三维立体视频上，可以很清楚的看清病变的部位、糜烂、充血的程度。
3.胃肠彩超检查
"三维立体胃肠彩超检查"是利用"美国(APOGEE)纳米胃肠超声系统"实现体外无创伤、无痛苦、非介入的新型胃肠病检查方法。具有三维成像技术，可以使图像更加清晰，逼真。能分清胃肠粘膜有无糜烂，水肿，及肿块的发生。
治疗胃肠炎应禁食、纠正水电解质紊乱。通常患者只需卧床休息并饮用足量的水分(如口服补液盐溶液)即可。即使是呕吐的患者也要尽量多饮水。哺乳期的婴儿应继续哺乳。如果呕吐或腹泻持续时间较长或有严重脱水，有必要进行静脉补液。呕吐剧烈时可加用止吐药。如果腹泻持续时间超过24～48小时并且没有迹象表明有更严重的细菌感染，可加用止泻药。通常儿童不建议使用止吐药和止泻药。
由于抗生素可能会引起腹泻或促进耐药菌生长，即使胃肠炎的致病菌已经明确，抗生素通常也不建议使用。但是，某些病原菌(如弯曲杆菌、志贺菌、霍乱弧菌等)感染或患者有旅行者腹泻，可使用抗生素。
对于病毒感染所致的胃肠炎，抗生素并无效果。寄生虫感染所致胃肠炎需使用抗寄生虫药物。
瓜果在生长期间要浇水、施肥，喷洒农药，在采集、搬运和*过程中，易被细菌感染，以致许多瓜果的表皮都带有细菌、虫卵和化学农药，所以瓜果在吃前必须用清水反复冲洗数次再吃。凡能削皮的瓜果，应削皮后再吃，否则易发生农药积蓄中毒。
瓜果在生长期间要浇水、施肥，喷洒农药，在采集、搬运和*过程中，易被细菌感染，以致许多瓜果的表皮都带有细菌、虫卵和化学农药，所以瓜果在吃前必须用清水反复冲洗数次再吃。凡能削皮的瓜果，应削皮后再吃，否则易发生农药积蓄中毒。
炎症期的肠胃功能减弱，要摄入清淡、低脂肪食物，最好食用流质食物和软质食物，这样有利于消化吸收，也减轻肠胃负担。一般就是熬煮稀饭喝了，为了补充食物控制减少的营养摄入，可以熬煮五谷类的稀饭。稀饭要尽量熬煮得烂一些，不要米粒生硬的稀饭。菜肴以嫩的青菜为主，青菜不要纤维太高的，肉类少吃一点，肉类尽量清煮，不要加姜蒜八角等刺激性香料。虽然要以流质食物为主，但也要少喝浓郁的汤，适量喝清淡的汤，牛奶等也尽量不要喝。
急性肠胃炎治疗期间要吃软质和流质食物，直到症状痊愈。刚刚痊愈的时候，其实肠胃功能也不还很弱，还要维持流质和软质食物为主，建议再维持三个月这样的饮食。期间，可以逐步适当补充其他食物，以补充营养，但要控制量，辛辣刺激等食物还是要避忌，万不可暴饮暴食。
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