怀孕11周到胎儿诞生前都可以取孕妇的静脉血，做胎儿的DNA检测。这种方式只需要取孕妇外周血，孕妇没有痛苦。而且准确率较高，能够避免胎儿宫内感染以及流产，是一种安全有效的方式。一般15天出检测结果。
母亲在怀孕8-12周（2-3个月）可以进行采取胎儿的绒毛进行亲子鉴定。一般都是由B超确定孕龄，然后进行绒毛穿刺检查，提取出少量绒毛组织做DNA物质的提取检测。这种方式胎儿有一定的感染的可能性。一般一周左右能够有检查结果。
在怀孕怀孕13-24周（3-6个月）就可以做胎儿羊水亲子鉴定。羊水采样时，一般是在B超辅助引导下抽取羊水。该孕期胎儿发育已经平稳，羊水相对丰富，提取少量羊水（2-4ml左右）对胎儿及产妇影响较小，相对安全可靠。在一周左右可以出结果。
亲子鉴定必须提供的样本为：胎儿样本（羊水）、母亲DNA样本、假定父亲DNA样本。另外，有创的检查容易和母体沾染造成样本污染，同时有可能引起流产及导致后期胎儿发育不健全等问题。所以，建议选择检查方式时要谨慎。
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