准妈妈和准爸爸如果有染色体的变异都会遗传给宝宝，基因突变成为自然流产的最主要的元凶。
最明显的是头3个月内的流产，其中一半是由于胚胎的染色体异常造成的，包括有，数目异常：
多见三体、X单体、三倍体等；结构异常：多为染色体断裂、倒置、缺失或易位。
流产成为染色体异常胚胎的多数结局，只有极少数的胚胎可能继续发育成胎宝宝，但出生后也多存在畸形或有功能缺陷。
准妈妈若患有流感、伤寒、肺炎等急性传染病，细菌毒素或病毒(如单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等)会通过胎盘进入胎宝宝体内，使胎宝宝停止发育导致流产。
高热可引起子宫收缩而导致流产。准妈妈如患有重度贫血、心力衰竭、慢性肾炎或高血压等慢性病，会因胎盘梗塞及子宫内缺氧而使胎宝宝畸形，从而导致流产。
还有一些情况，但并不常见，如准妈妈患有严重疾病的时候，引发严重的营养不良，也有可能使胚胎无法持续发育，最终导致流产。
如果准妈妈曾输过血，或在妊娠过程中产生和血型不合的致凝因子，就会使胎宝宝发生凝集和溶血，从而引起流产。
准妈妈和胎宝宝的血型不合主要有两种：
1、Rh型母儿血型不合：当母亲的血型为Rh阴性，胎宝宝为Rh阳性时，一旦胎宝宝血液进入母亲体内，母亲因Rh抗原致敏产生抗体，此抗体经胎盘进入胎宝宝血液引起溶血，可造成胎宝宝黄疸、贫血、肝脾肿大和心衰竭等；
2、ABO型血型不合：当准妈妈为O型血，胎宝宝为A型或B型血时，准妈妈体内可产生抗A或抗B抗体，随血液进入胎宝宝体内就可产生溶血。若出现以上现象，准妈妈需及时前往医院诊断后选择用药物治疗。
准妈妈若是子宫畸形(如双角子宫、子宫纵隔及子宫发育不良等)均会影响胚胎着床和发育不良而导致流产；子宫内口松驰或宫颈深度裂伤都会引起胎膜早破而发生晚期流产。
初次孕检特别重要，因为通常在初次孕检中，利用妇科窥器检查，就可以了解准妈妈阴道、宫颈情况，排除准妈妈生殖器官发育异常的可能。
如果查出有异常，准妈妈就应该遵循医嘱，及早处理。否则如果被动流产，对准妈妈的身体损伤会更大。
胎宝宝主要通过胎盘吸收母体的营养物质，如果胎盘发育不良或出现疾病，胎宝宝就会因得不到营养物质而停止生长引起流产。
内分泌的异常会使胎盘受到严重影响：
黄体功能不足往往影响蜕膜、胎盘而发生流产；孕激素分泌不足时，会使子宫蜕膜发育不良，从而影响受精卵的发育引起流产；前列腺素增多，会引起子宫肌肉的频繁收缩，也会导致流产；甲状腺功能的减退，会使细胞氧化能力产生障碍，进而影响胚胎的生长发育而导致流产。
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