试管婴儿过程中不会有太大的痛苦，取卵时会有疼痛感觉，但医生会适量使用镇静止痛药物，因此完全可以忍受，患者不必感到害怕。在整个过程，患者要始终保持良好的心态，这样更有利于提高试管婴儿的成功率。
做试管婴儿的痛苦程度，大多在可承受范围之内。整个过程中，疼痛还是有的，比如女性在取卵的时候可能会感觉到轻微的疼痛，而且胚胎移植过程中可能会出现一些不适。
取卵是试管婴儿技术环节中有微小痛感的环节，是在阴道B超引导下，经阴道穿刺术进行的。在穿刺取卵时可能有疼痛，但一般是实施麻醉的，所以不会有很大痛苦。其他环节就是每天注射药物和胚胎移植，一般不会有痛苦。
试管婴儿的痛苦往往在于周期过长，从检查-促排卵-取卵-体外受精-胚胎移植-黄体支持-妊娠的确定，整个过程耗时1-3个月左右，甚至不排除胚卵着床失败的概率，因为试管婴儿的成功率只有30%-40%；对夫妻双方来说，经济与心理压力较大，所以从这个角度来讲，也是痛苦的。
试管婴儿的手术风险相对较小。最常见的是穿刺取卵时穿刺部位出血、卵巢过度刺激综合征。而促排卵和取卵不会增加恶性肿瘤发生的几率、更不会导致卵巢功能减退、绝经提前。所以对于经济条件尚可，不孕的夫妻可以考虑做试管婴儿。
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